学术硕士是院校以培养教学和科研人才为主，毕业是颁发的学术型学位；而专业硕士是院校为社会培养可应用型的人才，是克服学术硕士的不足新增的一种培养方式，毕业可以获得硕士学位。
二、招生条件不同
学术硕士对于报考者没有特定的年限要求。而专业硕士在09年以前也没有特定的年限要求，但是在09年以后有年限要求，大专需要5年工作经验、本科需要3年工作经验，已获硕士学位或者博士学位的需要满两年工作经验，应届生是不可以直接报考的。
三、招生考试不同
学术硕士的考试是在十二月份进行的，参加的是全国统考，除此之外专业的考试是由招生院校自主出题、阅卷。专业硕士在2016年以前有两种考试方式，分别是十月份的联考和十二月份的考试。随着2016年在职研究生的改革，十月份的联考被取消，目前只剩十二月份这一种形式，考试难度相对较大。
四、入学难度不同
学术硕士是入学比较困难，但是一旦进入校园学习，课程结束毕业就比较简单。专业硕士录取比较困难，一般院校都是择优录取，考生之间竞争力度比较大。
五、学习方式不同
学术硕士一般学制是3年，非脱产进行学习；专业硕士学制一般是2-3年，可以进行脱产学习。
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